Процесс ведется на технологических линиях, состоящих из транспортных механизмов, сепараторов и магнитных колонок. Их комплект учитывает особенности структуры и физических свойств различных видов сырья (например, зерно с оболочками или без них, жмыхи или шроты, мука животного происхождения, дрожжи и т.д.).
Очистка сырья от посторонних примесей, таких как камни, стекло, обрывки веревок и тканей, куски дерева, бумага, осуществляется на подсевных ситах сепараторов. На некоторых предприятиях проводится очистка зерна от мучнистых примесей и лузги в процессе шелушения с использованием аспираторов и пневматических каналов. В отдельных случаях крупную минеральную примесь отделяют в специальных сухих флотационных агрегатах.
Во избежание повреждений и повышенного износа основного технологического оборудования на комбикормовых заводах в обязательном порядке проводят очистку сырья, а также кормосмесей от металлических примесей. Для этого применяются разнообразные конструкции электромагнитных сепараторов или статических магнитных колонок. Все магниты монтируются с учетом возможности их быстрой и безопасной очистки от металлических примесей. В обязательном порядке магнитная защита устанавливается перед основной приемной норией, перед молотковыми дробилками и грануляторами или экструдерами. Иногда для более надежной защиты магниты размещают блоками в несколько рядов. Очень важно осуществлять систематическую очистку магнитов от металлопримесей (как правило, от 1 до 3 раз в смену).