В числе массовых родов губок, населяющих мелководья и средние горизонты индо-тахоокеанских рифов, следует назвать следующие: Tethya, Plectronia, Mycale, Timea, Spirastrella, Ulosa, Higginsia, Pericharax, Jaspis, Neofibularia, Asteropus, Haliclona, Jantella, Phyllospongia, Dysidea, Ircinia, Carteriospongia, Pseudoazinissa, Scleroderma, Carmina. Reineria, Callyspongia, Cacospongia, Dictyonella, Prianos. Psamaplysilla. На внешнем склоне в глубинных зонах массовыми родами являются Spirorhabda, Hymedesmia, Acanthotriaena, Scleritoderma., Astrosclera, Leucetta, Murrayana. На малых и умеренных глубинах рифов Атлантики массовые рощи губок представляют: Tethya, Chondrilla, Haliclona, Gellioides, Iotrochota, Crantella, Cliona, Verongia. На нижних горизонтах склонов обитают: Amhimedon, Iotrochota, Ulosa, Ectypoplasia, Calyspongia, Niphates, Cliona, Xestospongia, Chondrilla, Anthosigmella. У подножия фор-рифа обычны склероспонгии Caratoроrella, Stromat-tospongia, Hispidoptera и известковая губка Leucetta (Lang et al., 1975). В колониях шых и мертвых кораллов, в щелях и пустотах скального флета и под камнями преобладают инкрустирующие вищи губок. Массовыми среди них являются представители родов: Erylis, Paratetilla, Tethya, Timea, Spirastrella, Ulosa, Higginsia (de Laubenfels, 1950; Reiswig, 1973; Hartman, 1977; Suchanek, 1983; Wilkinson, Trott, 1985).
В верхних горизонтах склона и на мелководьях флета преобладают фототрофные или сверлящие губки небольшими инкрустирующими или плоскими колониями, а также губки криптофауны, заселяющие щели скального субстрата. В приглубых зонах лагуны на мягких грунтах часто встречаются губки, которые до половины зарываются в осадок или прикрепляются к участкам твердого субстрата. В зарослях кораллов много инкрустирующих и сверлящих губок. Однако наибольшее разнообразие и наибольшее показатели их биомассы характерны для средних горизонтов в зонах опор и верхней части фор-рифа (Hartmann, Goreau, 1970; Vacelet, Vasseur, 1977; Bak, Luckhurst, 1980). Биомасса губок в мелководных зонах рифов в большинстве случаев составляет 10-150 г/м2, а на глубинах 20-40 м — 100-500 г/м2 (Reiswig, 1973; Wilkinson, Trott, 1985). Однако на флете некоторых рифов она иногда бывает достаточно высокой — до 1,2 кг/м2.
Обладая сравнительно высокой скоростью роста, губки и особенно их фототрофные вида во многих случаях успешно конкурируют с кораллами и другими представителями сидячего бентоса (Glynn, 1973). Среди них есть виды, токсичные дня соседских с ними кораллов. Контакт такой губки с кораллом вызывает некроз тканей последнего. Многие губки проявляют антибиотическую активность, образуя антибиотики, встроенные в мембраны клеток (Burkholder, 1973; Amade, Pesando, 1985). Предполагается, что они предотвращают их обрастание микрофлорой.
Питательная ценность губок очень низка. Ихвыеданию препятствуют также их игольчатая структура и токсичность многих их видов для донной фауны и рыб. Губками могут питаться лишь немногие виды рыб-тетрадонов, ежей и голожаберных моллюсков.