Морские ежи представлены на рифах четырьмя основными семействами: правильными ежами — диадемами и эхинометрами (сем. Diadematidae и Echinometridae) и неправильными ежами из сем. Clypeasteridae и Brissidae (сердцевидные ежи). В пределах отдельных рифовых систем число их видов составляет от 5 до 30. Общее число видов морских ежей на индо-тихоокеанских рифах достигает 140 (Clark, 1976). На Б. барьерном рифе 26 видов ежей и на рифах Филиппин — 39. Плотность отдельных видов популяций массовых видов диадем, эхинометр или средцевидных ежей может достигать 20-70 экз./м2 при их размерах 5-15 см в диаметре (Clark, 1974; Будин, 1980; Фадеев, Лукин, 1987). Морские ежи преимущественно ночные животные. Днем большинство из них прячутся в укрытия. Диадемы залезают в щели и промоины, выставив оттуда пучки своих длинных ядовитых игл. Эхинометры залезают в норки и углубления, которые они сами высверливают в скальном известняке. Сердцевидные ежи зарываются в песок.
В большинстве своем ежи всеядны. Диадемы и эхинометры питаются преимушественно макрофитами и перифитоном. Они поедают такие склерактиниевые кораллы и разнообразный микробентос (Bak, Van Eys, 1975; Sammarco, 1982; Hixon, 1985). Они соскребают со скального флета вместе с перифитоном и кораллинами спат кораллов и Мелких гастропод. Диадемы, по-видимому, способны питаться также и из толщи воды, как седиментаторы. Частички детрита и хлопья органики приклеиваются к их длинным иглам и на их поверхности перевариваются блуждающими амебоцитами (Thomassin et. al., 1982). Сердцевидные ежи питаются фораминиферами, мелкими моллюсками и микрофитобентосом. Суточный рацион ежей на литорали некоторых атлантических рифов оценивается в 1-4 г/м2 органического вещества в сутки (Ogden, 1977; Hatcher, 1983). Эти величины близки к 20-90% суточной продукции донных растений и составляют 1—6% от биомассы самих ежей.
Одно из наиболее распространенных на рифах семейств морских ежей — длинноиглые ежи и диадемы (Lessios et al., 1984). Иглы некоторых крупных диадем достигают длины 30-40 см. Иглы диадем ядовиты и служат им хорошей защитой. В состав семейства Diadematidae и родственного ему сем. Tripneuseidae входят массовые роды морских ежей, такие, как Diadema, Aseropyga, Echinothrix, Temnopleurus, Mespilia, Toxopheus-tes, Tripneustes, Nudechinus. На карибских рифах они представлены видами: Diadema antillarum, Astropyga radiata, A.magnifica, Echinoehrixcalamaris, Е. diadema, Tripheustes ventricosa. На рифах Индо-Пацифики массовыми видами диадем являются Diadema setosum, Diadema savighyi, Tripheustes pileosus, Т. gratilla, Echinothrix diadema, Е. calamaris (Endean, 1957; Ciark, 1976; Будан, 1980; Marsh, Marshall, 1983). В пучках длинных игл диадем находят убежище мизидцд мелкие рыбы и даже каракатицы. Другие широко распространенные на рифах группы правильных ежей - эхинометры и сидариды. Они включают такие массовые роды морских ежей как Echinometra, Echinostrephus, Heterecentrotus, Eucidaris. На индо-тихоокеанских рифах самыми массовыми видами эхинометр и сидарид являются Echinometra mathaei, Е. molaris, Е. oblonga, Echinostrephus acilulatus, Heterocentrotus mammillatus, Н. trigonarius, Ercidaris metularia, Е. thouarsii. На рифах западной Атлантики массовыми их представителями являются Echinometra lucunter, Е. viridis, Eucidaris tribuloides. У ежей-эхинометр относительно короткие прочные острые иглы. Гетероцентротусы — карандашные ежи-вооружены массивными известковыми палочковидными иглами, с помощью которых они передвигаются и высверливают себе убежища в скальном известняке.
На рыхлых грунтах рифа преобладают зарывающиеся в грунт неправильные ежи (сем. Clypeasteridae) и сердцевидные ежи (сем. Brissidae). Они имеют уплощенное тело и очень короткие плотно сидящие тонкие иглы. В числе неправильных ежей массовыми их представителями на рифах Атлантики являются Clypeaster rosaceus, Encope stockesi, Leodia sp., Metlita quinquesperforata, Echinoneus cyclostomus. На индо-тихоокеанских рифах массовым является последний вид, а также Clypeaster reticulatus, С. fervens, Echinodiscus bisperforatus, Е. auritus. Сердцевидные ежи на рифах Атлантики представлены видами Plagiobrissus grandis и Meoma ventricosa, а на рифах Индо-Панифи-ки — видами Metalia spatagus, M.sternalis, M.dicrana, Brissus latecarinatus, Rhinobrissus hemiasteroides. Неправильные ежи являются важным элементом макробентоса рыхлых осадков лагуны. Они часто образуют очень плотные видовые популяции с численностью 10-20 экз./м2 (Будин, 1980). В зарослях травы их численность может достигать 230 экз./м2 (Фадеев, Лукин, 1987).
Несмотря на свою защищенность многие ежи, особенно сердцевидные, служат важным объектом питания многих рыб-бентофагов, таких как диодоны и триггеры, а также крупных хищных гастропод и ландустов. Некоторые рыбы способны поедать даже диадем, переворачивая их на спинку выпускаемой ими из рта струей воды. Ежи диадемы, поедая в большом количестве водную растительность и осевшую молодь кораллов, а также и сами кораллы, оказывают существенное влияние на структуру донных сообществ флета (Bak, Van Eys, 1975; Benyahu, Loya, 1977; Ogden, Lobel, 1978; Wilhams, 1981, 1982; Sammarco, 1981; 1985; Sammarco et аl., 1974).