Обычно морские аквариумы не прикрываются стёклами. Исключение составляют чисто рыбные аквариумы или «банки» с пугливыми рыбами (например, великолепный красноплавничный бычок Nemateleotris magnificus), которые легко могут выпрыгнуть, или с рыбами, постоянно пытающимися вылезти из аквариума (например, мурены). Покровное стекло отражает или частично поглощает свет и, соответственно, изменяет освещённость и цветность. Особенно это проблематично в рифовых аквариумах, на оптимальное освещение которых тратится больше средств и времени. Однако, в некоторых случаях, использовать защитное стекло просто необходимо: к примеру, зимой в ночное время, так как при подобных условиях испаряется большое количество воды (в 800-литровых аквариумах до 5-6 литров ежедневно), которая конденсируется на самых холодных стенах и образует там очаги плесени. Если вы накрываете аквариум, то как минимум раз в неделю вам придётся чистить стекло, чтобы сквозь него проходило оптимальное количество света. В прохладное время аквариум можно накрывать только ночью, а днём чаще проветривать помещение и таким образом контролировать оседание паров воды на стены.
А вот летом накрывание аквариума может привести к нежелательному нагреву воды. И поскольку температура не должна превышать 28°С, придётся включать специальный охладительный прибор или — после снятия стекла — использовать вентилятор. При этом испарение усилится, и вода начнет охлаждаться.
Само по себе испарение воды из открытых аквариумов проблемой не является. Оно компенсируется добавлением либо чистой пресноводной воды, либо кальквассера. Никогда не используйте для этой цели морскую воду! Вливая пресную воду, следите за тем, чтобы она не попадала непосредственно на беспозвоночных.